El buen amigo ntpdate

Network Time Protocol (NTP) es un protocolo de internet para sincronizar los relojes de los sistemas informáticos a través de switcheo de paquetes en redes con latencia variable. NTP utiliza el puerto UDP 123 como su capa de transporte. Esta diseñado para resistir los efectos de la latencia variable.
- Gracias Wikipedia.

Antes de empezar una aclaración, el hecho de mantener sincronizada la hora en Linux actualmente es una cosa trivial, mas aún en Ubuntu, donde esto ya viene configurado por defecto.

A pesar de lo anterior, me parece importante explicar de forma sencilla como configurar ntpdate, afinando un poco más la configuración para que sincronize a través de servidores locales específicos a tu país o zona.

Ntpdate realiza el proceso de sincronización al inicio de Linux, por eso la importancia que tiene el hecho de agregar servidores lo más cercanos posible, ahorrándote así unos segundo en el proceso de booteo y tendrás el reloj de tu sistema actualizado de forma confiable.

Let's Go!
Como buen howto vamos a partir por el principio =) , y el principio es encontrar servidores ntp cercanos a tu país.
Pool.ntp.org tiene un listado extenso de servidores de libre acceso ordenados por continentes y país.

Elegido los servidores ntp, editamos agregando al archivo de configuración los servidores

$ sudo vim /etc/default/ntpdate

# servers to check. (Separate multiple servers with spaces.)
NTPSERVERS="shoa.ntp.cl"
NTPSERVERS="cl.pool.ntp.org"
NTPSERVERS="south-america.pool.ntp.org"
#
# additional options for ntpdate
#NTPOPTIONS="-v"
NTPOPTIONS="-u"

Yo agregue 3 servidores privilegiando poner primero el de mayor cercanía, ya que será a este al que se le realizará primero la petición, teniendo a los otros restantes como respaldo en caso de que falle.

NTPOPTIONS="-u" <-- significa que ntpdate se conectará a través de cualquier puerto sin privilegios, ideal para computadoras atrás de un firewall.

Concluyendo, ntpdate es un programa importante para nuestro sistema, que muchas veces pasa desapercibido, y que bien configurado debería seguir pasando desapercibido :P .